环境工程专业始办于1998年，并于同年获得环境工程工学硕士学位授予权，2004年取得工程领域硕士培养资格，2004年被评为江西省高等学校品牌专业，2006年江西省高等学校“十一五”重点建设学科，2010年获得环境科学与工程一级学科硕士学位授予权，2011年获批江西省高校“十二五”示范性硕士点，2012年获批“江西省矿冶环境污染控制重点实验室”。此外，环境科学与工程学科是学校“离子型稀土资源开发利用博士人才培养项目”的主要支撑学科之一，招收矿山环境与生态修复方向的博士研究生。

经过多年的学科建设，在中央和省、地方的资助下，通过学科方向凝炼、学科人才队伍引进培养、研究基地与学术平台建设等，结合江西省和国家发展战略的需要，充分发挥学校与国内钢铁、有色金属行业关系密切的行业优势，积极开展有色金属矿冶业领域的环境保护与治理的科学研究，逐步形成了矿冶废水处理与资源化、矿冶固体废物处理与资源化、工业烟气净化、矿山环境与生态修复、工业生态与清洁生产等五个成熟稳定的研究方向。